p-ISSN: 1306-696x | e-ISSN: 1307-7945

Quick Search

SCImago Journal & Country Rank
The microRNA expression profile in rat lung tissue early after burn injury [Ulus Travma Acil Cerrahi Derg]
Ulus Travma Acil Cerrahi Derg. 2018; 24(3): 191-198 | DOI: 10.5505/tjtes.2018.98123

The microRNA expression profile in rat lung tissue early after burn injury

Donghai Zhang1, Yang Chang2, Shaofang Han2, Longlong Yang2, Quan Hu2, Yonghui Yu2, Lingying Liu2, Jiake Chai2
1Department of Postgraduates, Chinese PLA Medical School, the Chinese PLA General Hospital, Beijing-People’s Republic China
2Department of Burn and Plastic Surgery, the First Affiliated Hospital of the PLA General Hospital, Beijing-People’s Republic China

BACKGROUND: Severe burn causes acute lung injury in many victims, but the related mechanisms have been barely investigated. microRNAs (miRNAs) important regulators in numerous physiological and pathophysiological process. However, the roles of miRNAs in burn lung injury are untested.
METHODS: Six healthy male Sprague–Dawley rats were randomly assigned into burn and sham groups. Lung injury was evaluated by hematoxylin and eosin (HE) staining at 24 h after injury. Differentially expressed miRNAs were determined by array hybridization and verified by real-time quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR). Bioinformatics analysis was undertaken to predict the target genes. Gene Ontology and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes databases were employed to identify potentially related biological processes and pathways, respectively. Neutrophil infiltration and apoptosis of the lung were confirmed by immunohistochemical staining of myeloperoxidase (MPO) and terminal deoxynucleotidyl transferase-mediated dUTP nick-end labeling (TUNEL).
RESULTS: HE sections showed obvious lung injury, and 21 upregulated and three downregulated miRNAs were detected. Target genes of these miRNAs were most highly enriched in inflammation and apoptosis related GO biological processes and pathways. Inflammation and apoptosis were confirmed by MPO and TUNEL staining.
CONCLUSION: The differentially expressed miRNAs most likely participate in burn-induced lung injury by being involved in inflammation and apoptosis.

Keywords: Apoptosis, burn; inflammation; lung injury/ARDS; microRNA.

Sıçan akciğer dokusunda yanık yaralanmasından sonra erken dönemde mikro RNA ekspresyon profili

Donghai Zhang1, Yang Chang2, Shaofang Han2, Longlong Yang2, Quan Hu2, Yonghui Yu2, Lingying Liu2, Jiake Chai2
1Çin PLA Tıp Okulu, Çin PLA Genel Hizmet Hastanesi, Mezunlar Bölümü, Pekin-Çin Halk Cumhuriyeti
2PLA Genel Hizmet Hastanesi, Yanık ve Plastik Cerrahi Bölümü, Pekin-Çin Halk Cumhuriyeti

AMAÇ: Ağır yanık birçok yaralıda akut akciğer hasarına neden olmakla birlikte ilişkin mekanizmalar pek araştırılmamıştır. Mikro RNA’lar (miRNA’lar) sayısız fizyolojik ve fizyopatolojik sürecin önemli düzenleyicidirler. Ancak yanığa bağlı akciğer hasarında miRNA’ların rolü test edilmemiştir.
GEREÇ VE YÖNTEM: Altı sağlıklı erkek Sprague–Dawley sıçanı yanık ve plasebo gruplarına rastgele dağıtıldı. Yanık olayından 24 saat sonra hematoksilen-eozin (HE) boyasıyla akciğer hasarı değerlendirildi. Farklı oranlarda eksprese edilen miRA’lar dizilim hibridizasyonu ile belirlenmiş, gerçek zamanlı nicel polimeraz zincir reaksiyonuyla (RT-qPCR) doğrulanmıştır. Biyoinformatik analizi ile hedef genler öngörüldü. Potansiyel olarak ilişkili biyolojik süreçler ve yolakları tanımlamak için sırasıyla Gen Ontolojisi (Gene Ontology) ve Kyoto Gen ve Geom Ansiklopedisi (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) veri tabanları kullanıldı. Akciğeri nötrofil infiltrasyou ve akciğer apoptozu miyeloperoksidaz immünohistokimyasal boyaması (MPO) ve TUNEL (terminal dezoksinükleotidil transferaz-aracılı dUTP nick- end labeling) yöntemiyle doğrulandı.
BULGULAR: HE boyalı kesitler açıkça akciğer hasarını gösterdi. Toplam 21 ‘up’regüle ve 3 ‘down’regüle miRNA saptandı. Bu miRNA’ların hedef genleri en yüksek oranda enflamasyon ve apoptozla ilişkili GO biyolojik süreç ve yolakları içerdi. MPO ve TUNEL boyamasıyla enflamasyon ve apoptoz doğrulandı.
TARTIŞMA: Farklı oranlarda eksprese edilen miRNA’lar enflamasyon ve apoptoza katılarak yanığa bağlı akciğer hasarında en büyük olasılıkla rol oynarlar.

Anahtar Kelimeler: Akciğer hasarı/ARDS, apoptoz; enflamasyon; mikroRNA; yanık.

Donghai Zhang, Yang Chang, Shaofang Han, Longlong Yang, Quan Hu, Yonghui Yu, Lingying Liu, Jiake Chai. The microRNA expression profile in rat lung tissue early after burn injury. Ulus Travma Acil Cerrahi Derg. 2018; 24(3): 191-198

Corresponding Author: Jiake Chai, China
Manuscript Language: English